RNA由核糖核苷酸经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和碱基构成。在细胞中,RNA种类繁多。根据结构功能的不同,RNA主要分三类,即tRNA、rRNA,以及mRNA。mRNA是依据DNA序列转录而成的蛋白质合成模板;tRNA是mRNA上遗传密码的识别者和氨基酸的转运者;rRNA是组成核糖体的部分,而核糖体是蛋白质合成的场所。细胞中还有许多种类和功能不一的小型RNA,像是组成剪接体(spliceosome)的snRNA,负责rRNA成型的snoRNA,以及参与RNAi作用的miRNA与siRNA等,可调节基因表达。为了使这种酶对降解的影响较小化,较好在采集时就稳定好样本中的 RNA。杭州正规RNA提取试剂厂家供应
RNA提取:主要试剂Trizol是一种新型总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速破碎细胞,压制细胞释放出的核酸酶。1. Trizol试剂含有苯酚,具有毒性和刺激性,注重操作。2. RNase污染的主要来源是操作过程中手和空气中的浮沉,注重配带手套,样品尽可能盖严。3. 细胞裂解必需充分且操作迅速。裂解不完全会降低较后得率,因为一部分RNA会残留在未裂解的细胞中。细胞裂解之后要看不见颗粒状物质(结缔组织和骨除外)。在清洗和裂解细胞时较好在低温下操作,防止在操作过程中释放的内源RNase降解了RNA。4. 酵母和一些细菌由于细胞壁的特别结构,可以加入Trizol试剂同时加入无RNase的玻璃珠并剧烈振荡,使细胞裂解充分。2-8℃ 避光保存一年。徐州正规RNA提取试剂厂家推荐RNA在260nm波长处有较大的吸收峰。
RNA是核糖核酸,DNA是脱氧核酸。区别:紫外吸收:核酸的λm=260nm,碱基展开程度越大,紫外吸收就越厉害。当A=1时,DNA:50ug/ml,RNA和单链DNA:40ug/ml,寡核苷酸:20ug/ml。用A260/A280还可来表示核酸的纯度。沉降速度:对于拓扑异构体(核苷酸数目相同的核酸),其沉降速度从达到小依次为:RNA ; 超螺旋DNA > 解链环状DNA ; 松弛环状DNA ; 线形DNA也就是在离心管中较上层是线形DNA,较下面是RNA。电泳:核苷酸、核酸均可以进行电泳,泳动速度主要由分子大小来决定,因此,电泳是测定核酸分子量的好方法。DNA分子量测定较直接的方法:用适当浓度的EB(溴嘧啶)染色DNA,可以将其他形式的DNA变成线形DNA,用电镜测出其长度,按B-DNA模型算出bp数,根据核苷酸的平均分子量就可计算出DNA的分子量。
RNA提取围绕DEPC的玄学。单纯高压过的蒸馏水或超纯水,基本可以视为无核酸酶活性等级的水。Thermo Fisher公司曾经做一项实验来说明这个问题。在PBS中加入不同浓度RNase A,高压或不高压,后溶解P-32标记RNA 探针。较后数据显示,除非原始的RNase A的浓度高达1 µg/ml,否则常规高压过的水,基本检测不出RNase A活性。当然,Thermo的科学家也很谨慎,说这个结论*适用于RNase A,不能推广到其他的RNase类型。不使用DEPC来处理RNA实验相关试剂和耗材,因为太费劲,而且DEPC还有毒性。相关的液体试剂,我会使用从公司购买的Nuclease-free的水来配制。没有很贵,一小瓶够用很久。很多时候买各种其他试剂,比如酶、siRNA等,也都会送这样的水。在耗材方面,直接使用大公司的离心管和吸头,根本不用担心核酸酶的问题。在实际RNA提取中,有几个提取原则:保证RNA一级结构的完整性。
rRNA是细胞内的一种基本RNA,与r蛋白一起构成蛋白质合成的场所—核糖体。随着rRNA基因序列越来越了解,其在生物研究中也的得到了更普遍的应用,主要表现在生物进化研究和分子流行病研究。(1)rRNA在生物进化上的研究。rRNA具有高度保守性,且普遍存在于各种生物中,rRNA提供了足够的序列信息。现在还可用于在细菌分类、细菌鉴定等方面。(2)rRNA在分子流行病上的研究。目前,人们已经把rRNA在进化上的普遍差异应用到了流行病学研究方面,通过对不同细菌进行鉴定分类,从而明确病因,追踪传染源,进一步控制及预防疾病。在提取时,实验人员需要佩戴口罩和手套等各种防护装备,以防实验室污染。宁波正规RNA提取试剂服务电话
他生物大分子如蛋白质、多糖和脂类分子的污染应降低到较低程度。杭州正规RNA提取试剂厂家供应
piRNA。是一类长度约为24-31nt的非编码小RNA,通过特异性地与PIWI蛋白结合而发挥生物学作用。现已发现其在生殖干细胞分化、胚胎发育、维持基因组完整性、表达遗传学调控、异染色质的形成和物种的性别决定等方面起着重要作用,此外在压制转座子转录和基因转录后调控中也扮演着重要角色,并且越来越多的研究表明在病症组织中piRNA的表达不尽相同。lncRNA。长度约为200-100000个核苷酸,可以通过不同的分子生物学机制调控编码基因的表达,参与疾病相关的信号通路,对疾病的发生、发展及医治有重要作用。研究发现,lncRNA-DANCR明显增强肝病细胞的感性特征,促进一些疾病细胞的形成,在体内干扰DANCR的作用可导致一些疾病细胞活力降低,同时阻止一些miRNA的压制效应,揭发出一个涉及lncRNA、mRNA和miRNA的新一些疾病形成机制。可见,lncRNA对一些疾病方面有重要作用。另外有研究发现lncRNA在宿主抗病菌反应、骨关节炎、囊性纤维化、药物研发等方面也有重要的临床应用价值。杭州正规RNA提取试剂厂家供应
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