植物RNA提取:植物组织中,富含酚类化合物,或富含多糖,或含有某些尚无法确定的次级代谢产物,或RNase的活性较高。这些物质在细胞裂解后与RNA紧密结合形成难溶复合物或者胶状沉淀,很难将其去除。所以我们在提取植物组织时,要选取针对植物的试剂盒,试剂盒里的裂解液能有效解决多酚易氧化、多糖化合物与核酸分离等难题。1、植物的果皮、果肉、种子、叶片等要在研钵中充分研磨,研磨过程中液氮要及时补充,避免样品融化,研磨后的样品应迅速加入裂解液中震荡混匀,避免RNA降解。2、像水稻及小麦叶片等富含纤维的样本,则应适当减少提取用量,否则组织研磨及裂解不彻底,会使提取的RNA产量较低。3、含水分较多的植物组织例如石榴果实、西瓜果实、桃子果实等则应当适当提高样本量(可选100~200mg)。4、植物组织,如植物叶片、根茎、坚硬的果实等材料一般建议使用液氮在研钵中彻底研钵成份,再继续进行提取步骤。常规的组织匀浆机对植物组织的匀浆效果可能不佳,一般不建议使用。RNA提取试剂:TRIpure试剂操作上的简单性允许同时处理多个样品,所有的操作可以在一小时内完成。南京长沙RNA提取试剂
RNA提取:预备工作(1)塑料制品:尽量使用一次性无菌塑料制品。已标明RNase-free的塑料制品,如没有开封使用过,通常不必再处理。处理的步骤如下:O在玻璃烧杯中注入去离子水,加入DEPC使其终浓度为0.05%~0.1%(DEPC-H2O)。(DEPC二乙基焦碳酸酯为活性很强的剧毒物,须在通风橱中小心使用)O将待处理的塑料制品放入一个可以高温灭菌的容器中,注入DEPC-H2O,使塑料制品的所有部分都浸泡到溶液中,在通风柜中37℃或室温下处理过夜。O将DEPC-H2O小心倒入废液瓶中,将装有DEPC-H2O处理过的塑料制品的容器以铝箔封口,高温高压蒸汽灭菌至少30分钟。O灭菌塑料制品烘烤干燥,置洁净处备用。(2)玻璃和金属物品250℃烘烤3小时以上。徐州长沙RNA提取试剂RNA的碱基配对规则基本和DNA相同,不过除了A-U、G-C配对外,G-U也可以配对。
miRNA是一类内源性的约22个核苷酸的非编码RNA分子,可参与转录后的基因调控。在细胞的分化和发育,细胞信号转导和对传染的应答等生物学过程中,miRNA发挥了重要作用。成熟的miRNA主要通过翻译压制来调控内源性基因的表达。miRNA的应用有miRNA模拟物和压制剂。miRNA模拟物是化学合成的双链RNA分子,通过传染到细胞中,模拟成熟的内源性miRNA分子;miRNA压制剂是单链经过修饰的RNA分子,通过传染到细胞中,特异性的压制miRNA的功能。miRNA模拟物和压制剂可以用于研究单个miRNA错误调节所造成的生物学影响,也能用于确定某个miRNA分子的特异性靶标基因。同时有研究发现miR-143可调控KRAS原病基因,为病症的医治提供了新的靶点和医治方法。
RNA提取浓度不高或质量不佳原因及解决办法:1、RNA降解:可能是提取样本本身降解,或者是在提取过程中导致的降级;应当尽可能使用新鲜样本进行RNA提取,采集的样本应当及时置于液氮或者-80℃冰箱冻存,并减少反复冻融。在RNA提取过程中应当使用RNase/DNasefree的吸头、离心管及其他材料,提取过程尽可能的快,提取后的RNA应置于冰盒上并及时放于-80冻存。如提取后的RNA需要进行凝胶电泳检测,则应提取好后立刻进行电泳,电泳缓冲液应更换新配制的。2、盐及有机溶剂残留:提取试剂中含有酚及胍盐,洗涤液中含有乙醇,在提取过程中裂解液吸弃不彻底,洗液没有充分晾干导致的,残留的盐及有机溶剂对后续的逆转录和PCR均存在不同程度的压制作用,因此在提取过程中应充分去除组织裂解液,洗涤时应充分,使管壁四周均能被洗涤到,另外管子空离和吹风是必须的步骤,会进一步降低有机物残留。目前常用Trizol法进行提取组织或细胞中的RNA。
RNA提取试剂TRIpure是基于世界上使用较普遍的异硫氰酸胍/酚法研制而成的总RNA抽提试剂。在破碎和溶解细胞时能保持RNA的完整性。无论是人、动物、植物还是细菌组织,该方法对少量的组织(50-100mg)和细胞(5×106)以及大量的组织(≥1g)和细胞(>107)均有较好的分离效果。TRIpure试剂操作上的简单性允许同时处理多个样品,所有的操作可以在一小时内完成。TRIpure抽提的总RNA能够避免DNA和蛋白的污染,故而能够作RNA印迹分析、斑点杂交、poly(A)+选择、体外翻译、RNA酶保护分析和分子克隆等。和进口品牌实验对照显示,公司的产品质量已经达到甚至超过了进口产品的质量在实际RNA提取中,有几个提取原则:保证RNA一级结构的完整性。苏州正规RNA提取试剂
植物RNA提取试剂:提取的总RNA纯度极高,没有蛋白和其他杂质的污染。南京长沙RNA提取试剂
RNA提取关键点病菌RNA在提取后也仍然具有传染性,在提取时,实验人员需要佩戴口罩和手套等各种防护装备,以防实验室污染。而有种「自动灭活」的方法,在更加便利的同时,也能更好的保护实验人员的安全。许多样品中含有高水平的RNase,这种酶也会加速RNA的降解。为了使这种酶对降解的影响较小化,较好在采集时就稳定好样本中的RNA。这种情况下,可以在裂解缓冲液中立即进行溶解。比如可以通过TRIzol®、RNA裂解缓冲液等使RNase失活,然后再处理样本。另外,再采集样本之后马上加入DNA/RNAShield,可以快速降解掉RNase等蛋白物质。当然,DNA/RNAShield也会保证取样时微生物基因多样性不会发生改变。南京长沙RNA提取试剂
将离心吸附柱转移到RNase-free收集管中,加入50~100μLRNA洗脱液,室温放置1~2分钟。12000rmp室温离心半分钟,离心管中溶液即为RNA样品,可以立即使用或存放于-80℃待用。昆虫RNA柱式提取试剂盒使用方法:将一半的溶液转移到离心吸附柱中,12000rmp室温离心半分钟,弃穿透液。将剩下的一半溶液转移到同一离心吸附柱中,12000rmp室温离心半分钟,弃穿透液。加0.7mL通用洗柱液,室温12000rmp离心半分钟,弃穿透液。加0.3mL通用洗柱液,室温12000rmp离心半分钟,弃穿透液。此步可以省略。室温12000rmp离心半分钟。此步十分重要,否则残留的乙醇会影响R...