在细胞中,根据结构功能的不同,RNA主要分三类,即tRNA(转运RNA),rRNA(核糖体RNA),mRNA(信使RNA)。mRNA是合成蛋白质的模板,内容按照细胞核中的DNA所转录;tRNA是mRNA上碱基序列(即遗传密码子)的识别者和氨基酸的转运者;rRNA是组成核糖体的组分,是蛋白质合成的工作场所。细胞中还有许多种类和功能不一的小型RNA,像是组成剪接体的snRNA,负责rRNA成型的snoRNA,以及参与RNAi作用的miRNA与siRNA等,可调节基因表达。而其他如I、II型内含子、RNaseP、HDV、核糖体RNA等等都有催化生化反应过程的活性,即具有酶的活性,这类RNA被称为核酶。在病菌方面,很多病菌只以RNA作为其中的遗传信息载体(有别于细胞生物普遍用双链DNA作载体)。总RNA提取试剂:自备新开封或专门氯仿,异丙醇,75%乙醇,DEPC处理水。贵阳RNA提取试剂推荐厂家
目前,主流的RNA提取方法有Trizol法、离心柱法和磁珠法。其中,Trizol法与离心柱法相比,提取效果相当,但因其对操作者带来的毒性,现在越来越被弃用。磁珠法可以针对大批量样本处理,适合机器自动化提取,但是提取核酸纯度低,提取得率低,且使用成本较高。对于拭子RNA含量较低的样本或比较珍贵的样本或样本总数不是很多的实验室,选择的拭子RNA提取方法应是离心柱法。近来,随着基因诊断技术的发展,从口腔拭子、泌尿生殖道拭子、痰液等样本中进行RNA提取的试剂盒的应用价值越来越大,如tumour早期诊断、遗传病检测和病原体传染核酸检测等。拭子RNA提取效果在很大程度上取决于采样质量、试剂盒性能等,特别是试剂盒的性能较大影响了拭子核酸的基因检测和各种研究的开展。上海正规RNA提取试剂平均价格普通的提取实验用国产的试剂盒就足以,价格不高,基本上各地均有现货。
RNA提取浓度不高或质量不佳原因及解决办法:1、得率过低:提取样本过低总量不足或者提取样本过多裂解不彻底;应当使用适当质量的组织或细胞进行提取,样本前处理一定要做好,裂解应充分。2、基因组残留:Trizol法提取时,分层后吸取上清时吸到中间层会带来严重的基因组污染;分层吸取时应当格外小心,不要吸取到中间层。如果是采用柱式法提取,可选择含有DNaseI的试剂盒进行提取,吸附在膜上的核酸直接用DNaseI进行消化,可极大限度的降低DNA残留。
细胞RNA提取的方法:实验提取步骤:标准Trizol提取步骤为液氮研磨--加入Trizol裂解--加入氯仿抽提--离心--加入氯丙醇沉淀--离心--酒精洗涤--离心。将细胞培养皿置于冰上,加入Trizol裂解5-10分钟,用泵头轻轻吹打后吸取液体放入进口EP管中。加入1/5体积的氯仿,上下混匀液体,4度静置10-15分钟。(氯仿为有机溶剂,有效的使有机相和无机相迅速分离。有机相中主要是酚和蛋白结合,从而使得蛋白和RNA脱离,RNA进入水相)。4度离心15分钟,一定注意选择低温离心。离心后分成三层,RNA在上清里,从离心机轻轻拿出EP管,以免管内物质震荡导致下层沉淀激起。吸取上清的时候一定要动作轻柔,切忌吸取太多,一般吸到400-500ul,避免吸到下层沉淀,将液体置于新的EP管中。加入等体积异丙醇,4度静置10min,然后12000rpm离心10min。RNA的碱基配对规则基本和DNA相同,不过除了A-U、G-C配对外,G-U也可以配对。
RNA提取试剂的选择:选择合适的提取试剂是较重要的一步。好的提取试剂在确保成功的同时,操作方便且经济实用。对于动物组织、简单的植物材料、各种微生物、培养细胞的totalRNA提取,Takara公司的RNAisoPlus具有诸多的成功案例。随着2013年7月柱型提取试剂TaKaRaMiniBESTUniversalTotalRNAExtractionKit的成功上市,进一步丰富了TakaraRNA提取的产品线。该产品采用了独特的细胞裂解系统,无需苯酚氯仿抽提等步骤,简单快捷。组织或细胞裂解后,提取操作光需20分钟便可完成。tRNA是mRNA上遗传密码的识别者和氨基酸的转运者。贵阳RNA提取试剂推荐厂家
RNA提取试剂注意事项:有机相用异丙醇沉淀可回收蛋白。贵阳RNA提取试剂推荐厂家
尽管现有的RNA提取试剂都用压制RNase的成分,但提取的材料仍需谨慎处理。提取的材料的新鲜度是获取完整RNA的关键,但是由于种种原因无法立即从新鲜材料中提取RNA时,使用Takara公司的样品保护剂SampleProtectorforRNA/DNA可以免去使用液氮或超低温冰箱的不便,同时也可以有效解决组织、细胞样品的短时间保存及运输问题。此外,如果将不同时期收集的样品都预先存放于本试剂中,可以做到立即终止并固定RNA表达的时序变化,减少实验组间的误差,RNA提取试剂的选择:首先,要确定材料的可用性。贵阳RNA提取试剂推荐厂家
血浆/血清中miRNA提取试剂盒:是专门针对血清、血浆样本中miRNA提取而开发的,利用吸附柱法从血清、血浆样品中简单快捷提取高纯度高质量的miRNA。该试剂盒中的裂解液miRBP1及柱结合液miRBP2具有高效裂解及提取效果。试剂盒中的吸附柱采用特殊的硅基质膜材料,对RNA尤其是smallRNA(