河南消化道疾病菌群检测预测疾病

药物微生物组学是一门新兴学科，关注药物与菌群之间的复杂互作。Nature Reviews Rheumatology上发表的一篇综述文章，详细介绍了在炎症性关节炎（包括类风湿关节炎、银屑病关节炎及强直性脊柱炎）中，肠道菌群如何通过调节药物的生物利用度、活性及毒性，以影响药物的改善效果，并讨论了如何将药物微生物组学应用于炎症性关节炎的精细医疗之中。①在多种疾病中，药物-菌群互作可影响患者对药物改善的应答；②肠道菌群及其代谢产物可调节炎症性关节炎改善药物的生物利用度、临床疗效及毒性；③例如，柳氮磺胺吡啶可被肠道菌群代谢为活性形式，而甲氨蝶呤可被肠道菌群代谢为非活性形式；④药物微生物组学研究用于炎症性关节炎精细医疗的潜在策略包括：肠道菌群作为预测改善应答的生物标志物、调控菌群以增加药物的生物利用度及疗效、抑制特定细菌酶活性以防止其将药物代谢为毒性产物。肠道菌群检测--科研前沿的应用。河南消化道疾病菌群检测预测疾病

AnnalsoftheRheumaticDiseases上发表的一项研究，对类风湿关节炎（RA）患者及健康人的肠道菌群进行了宏基因组关联分析，鉴定出了一些与RA相关的菌种及菌群功能，并发现了一些具有人种特异性的RA相关的宏基因组-宿主基因组关联，提示宿主基因组、肠道菌群及RA的发病机制之间存在密切联系。①纳入82名类风湿关节炎（RA）患者及42名健康对照，对肠道菌群进行全基因组深度测序；②RA患者的肠道菌群宏基因组中，普氏菌属中多个菌种的丰度高于健康人；③RA患者的肠道菌群宏基因组中，R6FCZ7（与氧化还原反应相关的基因）的丰度明显低于健康人，而代谢相关通路（脂肪酸生物合成、粘多糖降解等）明显富集；④通过对比宏基因组关联分析（MWAS）与全基因组关联分析（GWAS），鉴定出一些RA相关的宏基因组-宿主基因组之间相关的通路。安徽消化道疾病菌群检测预测疾病肠道菌群与人类健康息息相关。

强直性脊柱炎患者的肠道菌群组成及细菌表位变化：①纳入127名强直性脊柱炎（AS）患者与123名健康人，对粪便菌群进行宏基因组测序；②鉴定出7个菌种在AS患者与健康人中有明显差异，在菌株水平未发现AS患者与健康人的明显差异；③抗TNF改善与AS患者的菌群变化（患者失调的菌群更趋近于健康人，包括一些与AS相关的菌种）相关；④AS患者粪便中可检测到特定细菌表位（与HLA-B27呈递的表位相似）的富集，抗TNF改善与这些潜在交叉反应性细菌表位的减少相关。

GenomeMedicine近期发表的文章，通过对RA病人的粪便菌群进行宏基因组测序分析，发现RA患者中存在与疾病活动指数——MCII相关的肠道菌群的分类和功能特征，且利用肠道菌群特征进行AI训练预测哪些患者MCII状态会发生改变，效果明显。提示我们改变肠道菌群以提高临床疗效可能是RA未来改善的希望。①对1988年-2014年间诊断为RA的患者进行回顾性、观察性队列研究，收集64份粪便样本进行宏基因组测序；②年龄是导致肠道菌群组成差异的比较大决定因素，其次是疾病活动指数——MCII状态，且MCII+和MCII-患者的基线肠道菌群特征、功能性生化途径都存在明显差异；③基线检查和随访中，取得临床改善的患者肠道菌群的α多样性较高；④神经网络利用肠道菌群预测哪些患者MCII状态会发生改变，被证明是非常有效的，证明了肠道菌群的潜在临床实用性。我们为什么需要肠道菌群检测？

菌群在风湿病及其它自身免疫疾病的发***展中发挥重要作用。AnnalsoftheRheumaticDiseases上发表的一篇综述文章，介绍了一些在风湿病及自身免疫疾病领域中的标志性菌群研究，并讨论了风湿病相关菌群研究中存在的机会与挑战，展望了将菌群研究应用于风湿病诊疗中的未来可能。①肠道菌群是触发和驱动自身免疫疾病必需的，自身免疫疾病患者的肠道菌群多样性降低，拟杆菌属等减少，共生致病菌（梭杆菌属等）升高；②药物微生物组学可改善风湿病药物的选择；③通过饮食、益生菌/元等间接调节菌群或可改善风湿病，例如地中海饮食可能对类风湿关节炎有益，益生元可能缓解脊柱关节炎；④通过粪菌移植直接调节菌群也可能改善风湿病，但目前还缺乏决定性证据；⑤菌群研究有助于风湿病和自身免疫性疾病的精细调节。肠道菌群检测--高通量测序平台的应用。上海肿瘤术后菌群检测预测疾病

肠道菌群检测的取样要求。河南消化道疾病菌群检测预测疾病

NatureReviewsRheumatology近日发表了一篇关于“肠-关节”轴的综述文章，总结了目前对于“菌群-关节炎”的大量研究。文章指出，肠道菌群组成的改变在许多类风湿关节炎（RA）患者以及处于潜伏期的患者中都存在；“菌群-关节炎”致病假说指出，关节炎由肠道黏膜免疫和异常的局部菌群相互作用，进而过渡到滑膜及关节部位所引起，同时，RA患者以及关节炎小鼠模型都伴随着肠道通透性增加、炎症细胞增加、有益菌丰度降低、肠-肌腱细胞的迁移等表型，抗风湿药能明显改善RA患者肠道菌群的失衡。因此，靶向肠道、菌群及代谢物，改善肠黏膜通透性和调控炎症细胞的迁移都可能成为有潜力的治疗方案。河南消化道疾病菌群检测预测疾病

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