PCR实验技术中的兼并引物PCR（DegeneratePrimer）介绍：兼并引物是指代替编码单个氨基酸所有不同碱基可能性的不同序列的混合物。兼并度越低，产物特异性越强。设计引物时应尽量选择兼并性小的氨基酸，并避免引物3’末端兼并，因为3'端末尾3个碱基的退火足以在错误位点起始PCR；次黄嘌呤可以同所有的碱基配对，降低引物的退火温度。因此，在引物设计时,比较选择兼并性小的氨基酸，并避免引物3'端被兼并，因为3'端末尾3个碱基的退火足以在错误位点起始PCR;次黄嘌呤可以同所有的碱基配对，降低引物的退火温度。实验证明，用脱氧肌苷引物进行PCR,可以代替编码蛋白的多种兼并密码子中的兼并碱基。pcr检测样本的保存要求与方法？云南靠谱pcr
PCR实验技术中的反向PCR介绍：反向PCR的目的在于扩增一段已知序列旁侧的DNA，也就是说这一反应体系不是在一对引物之间而是在引物外侧合成DNA.反向PCR可用于研究与已知DNA区段相连接的未知染色体序列，因此又称为染色体步移。这时选择的引物虽然与中心DNA两末端序列互补，但引物3’端是相互反向的。反向PCR的操作流程：扩增前先用限制性内切酶酶切样品DNA，然后用DNA连接酶连接成一个环状分子，通过反向PCR扩增引物的上游片段和下游片段。选择多种限制性内切酶，基本准则是选择不能在非酶切位点切断靶DNA的酶。裂解中心区的内切酶使反向PCR只能扩增引物所定模板(依赖于引物)的上游或下游区，而不裂解中心区的酶则使两侧序列都扩增Southern杂交来确定内切酶用以产生大小适于环化及反向PCR的片段的末端片段大多数有核基因组含有大量中度和高度重复序列，所以往往需要两组到三组嵌套引物湖北高质量pcr实验pcr检测知识要点总结汇总。
PCR实验技术中的定量PCR（QuantitativePCR）介绍：由于序列扩增的产量依赖于模板DNA的量，所以PCR常用于对样品中DNA进行定量，常用的应用是基因表达的定量。终点法PCR是一种可能的方法，但其有较大的缺点，通过凝胶电泳来检测产量，检测的灵敏度非常有限。更重要的是，使用终点PCR是在PCR反应结束后进行定量，此时扩增已经达到平台期（图11），DNA凝胶染色的强度与DNA起始量不成线性关系。尽管如此，通过终点法PCR可以对基因表达进行半定量，可以使用一系列稀释程度不同的DNA样本作为模板起始量，或者在特定的PCR循环处获取扩增产物，然后通过凝胶显色强度来估计基因的表达量。
PCR的假阳性主要原因之一出现非特异性扩增带：PCR扩增后出现的条带与预计的大小不一致，或大或小，或者同时出现特异性扩增带与非特异性扩增带。非特异性条带的出现，其原因：一是引物与靶序列不完全互补、或引物聚合形成二聚体。二是Mg2+离子浓度过高、退火温度过低，及PCR循环次数过多有关。其次是酶的质和量，往往一些来源的酶易出现非特异条带而另一来源的酶则不出现，酶量过多有时也会出现非特异性扩增。其对策有：必要时重新设计引物。减低酶量或调换另一来源的酶。降低引物量，适当增加模板量，减少循环次数。适当提高退火温度或采用二温度点法（93℃变性，65℃左右退火与延伸）。PCR的假阳性主要原因之一出现片状拖带或涂抹带：PCR扩增有时出现涂抹带或片状带或地毯样带。其原因往往由于酶量过多或酶的质量差，dNTP浓度过高，Mg2+浓度过高，退火温度过低，循环次数过多引起。其对策有：减少酶量，或调换另一来源的酶。②减少dNTP的浓度。适当降低Mg2+浓度。增加模板量，减少循环次数。pcr检测实验成功的诀窍！
PCR反应的特异性决定因素为：①引物与模板DNA特异正确的结合；②碱基配对原则；③TaqDNA聚合酶合成反应的忠实性；④靶基因的特异性与保守性。其中引物与模板的正确结合是关键。引物与模板的结合及引物链的延伸是遵循碱基配对原则的。聚合酶合成反应的忠实性及TaqDNA聚合酶耐高温性，使反应中模板与引物的结合(复性)可以在较高的温度下进行，结合的特异性明显增加，被扩增的靶基因片段也就能保持很高的正确度。再通过选择特异性和保守性高的靶基因区，其特异性程度就更高。英瀚斯生物，确保pcr检测结果真实性。浙江荧光定量pcr实验室
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PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成：
1、模板DNA的变性：模板DNA经加热至93℃左右一定时间后，使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离，使之成为单链，以便它与引物结合，为下轮反应作准备。
2、模板DNA与引物的退火（复性）：模板DNA经加热变性成单链后，温度降至55℃左右，引物与模板DNA单链的互补序列配对结合。3、引物的延伸：DNA模板--引物结合物在72℃、DNA聚合酶（如TaqDNA聚合酶）的作用下，以dNTP为反应原料，靶序列为模板，按碱基互补配对与半保留复制原理，合成一条新的与模板DNA链互补的半保留复制链。重复循环变性--退火--延伸三过程就可获得更多的“半保留复制链”，而且这种新链又可成为下次循环的模板。每完成一个循环需2～4分钟，2～3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍 云南靠谱pcr
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