广东腹泻菌群检测临床应用

强直性脊柱炎患者的肠道菌群组成及细菌表位变化：①纳入127名强直性脊柱炎（AS）患者与123名健康人，对粪便菌群进行宏基因组测序；②鉴定出7个菌种在AS患者与健康人中有明显差异，在菌株水平未发现AS患者与健康人的明显差异；③抗TNF改善与AS患者的菌群变化（患者失调的菌群更趋近于健康人，包括一些与AS相关的菌种）相关；④AS患者粪便中可检测到特定细菌表位（与HLA-B27呈递的表位相似）的富集，抗TNF改善与这些潜在交叉反应性细菌表位的减少相关。而这一领域的研究进展，主要体现在菌群检测技术的发展和运用上。广东腹泻菌群检测临床应用

有研究显示肠道菌群变化会影响代谢内稳态，而肠道菌群和代谢的扰动或促进类风湿性关节炎的早期发展。山东第一医科大学JinxiangHan、华中科技大学宁康和山东大学张磊与研究团队在Gut发表文章，招募健康对照（27）、骨性关节炎（OA，19）和类风湿关节炎（RA，76）患者，对肠道宏基因组、临床表型、血液和膝关节滑液中的代谢物进行分析，发现大肠杆菌和牛链球菌促进抗坏血酸的降解，促进促炎反应，加速炎症性关节炎的发展。即肠道菌群可调控RA的进展，或成为RA的潜在靶点。上海专业菌群检测报告内容菌群检测可以为医生提供关于患者疾病的具体信息，从而指导医生制定更个性化的治疗方案。

人体内有两个基因组，一个是人基因组，编码大约2.5万个基因；另一个则是出生以后才进入人体、特别是肠道内的多达1000多种的共生微生物，其遗传信息的总和叫“微生物组”，也可称为“宏基因组”或“元基因组”，它们所编码的基因有100万个以上。两个基因组相互协调、和谐一致，保证了人体的健康。人类基因组计划在2003年完成以后，许多科学家已经认识到人类基因组基因并不能完全掌握人类疾病与健康的关键问题，因为人类对自身体内数量巨大的，与人体共生的微生物菌群，几乎一无所知。人体内微生物细胞的数量是人体内细胞数量的10倍，初步的研究显示，其所含基因数目的总和是人类基因组所含基因数目总和的100倍。但是，由于传统微生物学研究方法的局限，对生活在自己体内的95%以上的微生物没有任何研究数据。

    自从引入了细菌的基因组学分析以来，针对微生物的研究已经产生**性变化。16SrDNA测序和宏基因组测序两种测序方法，常用于评估微生物组成机器相对丰度。16S测序可以以可变区域周围的稳定区域为八项来检测细菌基因组中高变异度区域的差异。这一技术的主要缺陷在于无法分辨种群之间的差异，因为这种差异通常很小。相反地，宏基因组测序能够实时检测所有生物的全基因组，这也造成针对意志和位置的微生物检测的精度增加。本章阐述了与心血管疾病相关的肠道微生物组成的变化。 肠道菌群检测的临床指导意义！

约50%的类风湿关节炎（RA）患者对甲氨蝶呤改善不产生充分的应答，但缺乏可预测患者应答的预后标志物。ArthritisandRheumatology上发表的一项新研究，对比分析了对甲氨蝶呤改善应答及不应答的RA患者在改善前的肠道菌群差异，发现基于菌群建立的模型可较准确地预测患者对甲氨蝶呤改善的应答。另外，体外共培养肠道菌群与甲氨蝶呤的结果表明，肠道菌群对甲氨蝶呤的代谢或减少可能抑制甲氨蝶呤的改善效果。①纳入26名新发RA患者，16名对甲氨蝶呤改善不应答；②应答患者与不应答患者的粪便菌群多样性、组成及功能存在差异；③不应答患者的菌群多样性更高，厚壁菌门/拟杆菌门比值增加，广古菌门丰度升高，MAPK信号、DNA复制、脂肪酸降解、嘌呤代谢等相关通路明显富集；④在另外21名新发RA患者中，基于菌群的模型可较准确地预测对甲氨蝶呤改善的应答（AUC=）；⑤体外共培养患者的粪便菌群与甲氨蝶呤，培养后的甲氨蝶呤水平与患者应答明显相关。肠道菌群检测--解读人类“第二基因组”。江苏专业菌群检测预测疾病

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菌群在风湿病及其它自身免疫疾病的发***展中发挥重要作用。AnnalsoftheRheumaticDiseases上发表的一篇综述文章，介绍了一些在风湿病及自身免疫疾病领域中的标志性菌群研究，并讨论了风湿病相关菌群研究中存在的机会与挑战，展望了将菌群研究应用于风湿病诊疗中的未来可能。①肠道菌群是触发和驱动自身免疫疾病必需的，自身免疫疾病患者的肠道菌群多样性降低，拟杆菌属等减少，共生致病菌（梭杆菌属等）升高；②药物微生物组学可改善风湿病药物的选择；③通过饮食、益生菌/元等间接调节菌群或可改善风湿病，例如地中海饮食可能对类风湿关节炎有益，益生元可能缓解脊柱关节炎；④通过粪菌移植直接调节菌群也可能改善风湿病，但目前还缺乏决定性证据；⑤菌群研究有助于风湿病和自身免疫性疾病的精细调节。广东腹泻菌群检测临床应用