厦门组织PCR检测技术原理及步骤

Real-time PCR链反应的常见问题分析与解决方法：反应缓冲液未完全融化或未充分混匀。确保反应缓冲液融化完全并彻底混匀。引物特异性差。利用BLAST检查引物特异性或重新设计引物。引物量过多。减少反应体系中引物的用量。模板量过多。质粒DNA的用量应<50ng，而基因组DNA则应<200ng。外源DNA污染。确保操作的洁净。阴性对照出现条带：试剂，头，工作台污染。使用全新的试剂和头，对工作台进行清洁。条带大小与理论不符：污染。使用全新的试剂和头，对工作台进行清洁。模板或引物使用错误。更换引物和模板。基因亚型。对研究的基因进行序列分析和BLAST研究。逆转录-聚合酶链反应较广用于表达谱，以确定基因的表达或鉴定RNA转录物的序列。Real-time PCR技术已经被普遍用于监测细胞mRNA表达量的变化。厦门组织PCR检测技术原理及步骤

为了便于对所检测样本进行比较，在real-timeQ-PCR反应的指数期，首先需设定一定荧光信号的域值，一般这个域值（threshold）是以PCR反应的前15个循环的荧光信号作为荧光本底信号（baseline），荧光域值的缺省设置是3～15个循环的荧光信号的标准偏差的10倍。如果检测到荧光信号超过域值被认为是真正的信号，它可用于定义样本的域值循环数（Ct）。Ct值的含义是：每个反应管内的荧光信号达到设定的域值时所经历的循环数。研究表明，每个模板的Ct值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系，起始拷贝数越多，Ct值越小。利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线，因此只要获得未知样品的Ct值，即可从标准曲线上计算出该样品的起始拷贝数。厦门组织PCR检测技术原理及步骤实时荧光定量PCR法较大的优点是克服了终点PCR法进入平台期或叫饱和期后定量的较大误差。

Real-time PCR萤光染料掺入法:在PCR反应体系中，加入过量SYBR萤光染料，SYBR萤光染料特异性地掺入DNA双链后，发射萤光信号，而不掺入链中的SYBR染料分子不会发射任何萤光信号，从而保证萤光信号的增加与PCR产物的增加完全同步。此方法适用于：1、灵敏度高：使用SYBR可使萤光效果增强到1000倍以上。2、通用性好,不需要设计探针,方法简便,省时,价格低廉。3、通用型方法，在国内外科研中普遍使用。4、高通量大规模的定量PCR检测。5、专一性要求不高的定量PCR检测。

Real-time PCR与普通PCR的实验目的不同，所以对引物的设计要求也不同。普通PCR的实验目的只是为了获得目的基因产物，允许有非特异扩增，只要目标条带清晰明亮，就可以通过切胶回收的方法回收目标条带，之后进行后续的克隆、测序。但Real-time PCR的目的是为了让目的基因按照理论值或是按照接近理论值进行扩增，只有这样的扩增后续由Ct值推算出的起始量模板量才准确，基于此，Real-time PCR对非特异性扩增和引物二聚体的存在有较严格的要求。Real-time PCR的基本目标是精确测量和鉴别非常微量的特异性核酸。

Real-time PCR原理：基于探针的化学法，Real-time PCR应用一个或多个荧光标记的寡核苷酸探针检测PCR扩增产物；依赖荧光能量共振传递（FRET）检测特异性扩增产物，单单检测特异性扩增产物，DNA及RNA定量；基因表达验证；等位基因鉴别；SNP分型；病原体和病毒检测；多重PCR，探针和目标片段的特异性结合产生荧光信号，因此减少了背景荧光和假阳性；探针可标记不同波长的荧光基团，用于多重PCR反应。对于不同的靶序列需要合成不同的探针，原料成本较高。Real-time PCR探针法普遍用于人类传染病的诊断和病原定量。上海细胞荧光定量PCR

使用Real-time PCR进行基因检测,被普遍应用于病毒和病原菌检测基因检测等领域。厦门组织PCR检测技术原理及步骤

实时定量PCR的系统构成及工作原理：荧光定量检测系统由实时荧光定量PCR仪，实时荧光定量试剂，通用电脑，自动分析软件等构成。设备由荧光定量系统和计算机组成，用来监测循环过程的荧光。与实时设备相连的计算机收集荧光数据。数据通过开发的实时分析软件以图表的形式显示。原始数据被绘制成荧光强度相对于循环数的图表。原始数据收集后可以开始分析。实时设备的软件能使收集到的数据进行正常化处理来弥补背景荧光的差异。正常化后可以设定域值水平，这就是分析荧光数据的水平。厦门组织PCR检测技术原理及步骤

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