研究外泌体介导的microRNA的调控机制,第一步通过microRNA表达谱的检测分析来源于肝病细胞的外泌体。第二步,应用肝细胞和外泌体共培养实验得出以下结论:来源于肝病细胞的外泌体能促进肝病细胞的生长及迁移侵袭,且外泌体有运输microRNA至受体细胞的功能。第三步,研究发现Vps4A是一个外泌体的重要调控因子,与肝病的发生有着密切的关系,Vps4A基因的表达下调肝病的发生及转移相关。通过microRNA高通量测序发现Vps4A基因能导致外泌体分泌肝病相关的重要microRNA,与肝病的发生密切相关。外泌体是分泌的细胞外囊泡的主要群体,是具有生物活性的脂双层囊泡。唾液外泌体circRNA测序
全转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA,主要为mRNA和lncRNA、circRNA等非编码RNA。外泌体中携带有来自母本细胞的多种蛋白质、脂类、短链RNA和长链RNA等重要信息。对外泌体中的长链RNA进行全转录组测序及分析,不只能够筛选外泌体携带的特异Biomarker,同时对深入了解疾病或不同发育阶段的内在机制也有重要意义。外泌体全转录组测序体系,充分结合了微量核酸建库技术、NGS技术和全新的生物信息序列比对算法,可实现对1mL血浆中的外泌体即可进行mRNA、lncRNA和circRNA等RNAs充分测序,获取周全的外泌体转录组信息。腹膜透析液外泌体iTRAQ外泌体是其中一类小囊泡,直径为30~150nm,密度1.10~1.18g/ml。
常规生物学实验中,实时定量PCR技术(RT-PCR)普遍用于microRNA的检测实践中,但外泌体样品中的microRNA丰度极低,普通RT-PCR技术的灵敏度已经不能够满足。第三代微滴式数字PCR——ddPCR技术,成为外泌体microRNA检测的选择技术。微滴式数字PCR(DropletdigitalPCR),又成为“油包水PCR”,在传统的PCR扩增前对样品进行微滴化处理,即将含有核酸分子的反应体系分成成千上万个纳升级的微滴,其中每个微滴或不含待检核酸靶分子,或者含有一个至数个待检核酸靶分子。经PCR扩增后,逐个对每个微滴进行检测,有荧光信号的微滴判读为1,没有荧光信号的微滴判读为0,根据泊松分布原理及阳性微滴的个数与比例即可得出靶分子的起始拷贝数或浓度。
磁珠免疫法分离外泌体:将针对目的抗原的抗体通过生物素-链霉亲和素连接到磁珠表面,然后将磁珠与样品共孵育,使外泌体特异性结合到磁珠上形成磁珠-外泌体复合物,再用蒸馏水或者PBS冲洗,结尾用甘氨酸-Tris-HCl溶液洗脱获得外泌体。该方法相对于ELISA的好处主要是,珠粒提供了更大的表面积来捕获外泌体,从而提高了分离效率。此外,使用磁珠时,样品起始体积没有上限,而基于微孔板的ELISA分析的较大样品体积为100μL,且ELISA洗脱杂质时容易造成孔间交叉污染。当将磁珠法与金标准外泌体分离方法进行比较时,磁珠法可分离出更纯净的外泌体,特异性高、速度更快,并且不需要昂贵的仪器。另外,与其他分离方法(如超速离心或超滤)相比,磁珠法不影响外泌体形态。但是采用磁珠法时,外泌体生物活性易受PH和盐浓度影响。外泌体作为蛋白质的药物递送载体。
酶联免疫吸附测定(ELISA):将其中一种针对外泌体表面抗原的抗体固定在微孔板的表面上,将外泌体样品暴露于含有固定抗体的孔中,由于抗体-抗原相互作用,表达抗原的外泌体将被捕获固定在板上。将未捕获的样品内容物洗掉,并使用另一种抗体检测固定的外泌体。ELISA已用于从尿液、血浆和血清中分离出外泌体,当使用标准液(已知外泌体的量)创建标准曲线时,甚至可以进行定量。但是,此方法需要通过超速离心或超滤对样品进行预处理。同样,流场-流分离与紫外线分析仪和光散射检测器相结合已被用于分析外泌体的大小和纯度。外泌体属于胞外囊泡类,除了外泌体之外细胞还分泌微泡以及其它的膜囊泡。外泌体可以包含不同类型的细胞表面蛋白、细胞内蛋白、RNA、DNA、氨基酸和代谢物。细胞上清外泌体测序
从研究上来讲并不太严格区分外泌体或微泡。唾液外泌体circRNA测序
AFC自动收集器是将qEV分离法这一过程自动化的仪器,将用来收集外泌体样本的微量离心管放置在AFC的中间转盘内,根据称重精确测量流体体积,可精确的测量到样品中每一个液滴的重量并精确测量总重量。将在空隙体积之前从qEV柱洗脱的流体收集到AFC转盘的单独中心孔中并送至废液桶,避免将不需要的空隙部分收集到微量离心管中。在提取期间,当达到设定的提取体积后,转盘会自动旋转到下一个微量离心管继续收集,到收集完成后自动停止。微滴式数字PCR技术不佳有效提高了核酸分子的扩增效率,而且由于采用微滴计数的方法进行定量,可以不依赖与RT-PCR的荧光信号和Ct值,对所测样品中的核酸分子进行一定定量。从研究上来讲并不太严格区分外泌体或微泡。唾液外泌体circRNA测序
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