首先，要选择正规厂家的产品。具备农业部微生物肥料登记证，包括：微生物菌剂登记证、生物有机肥登记证，或复合微生物肥料登记证；
其次，要核对执行标准。农用微生物菌剂执行的是国家标准，为GB20287-2006，生物有机肥和复合微生物肥执行的是行业标准，分别为NY884---2012和NY/T798-2015；
再次，要查看包装袋上菌数的标注。菌剂中的有效活菌数液体含量要≥2亿/克颗粒的要≥1亿/克，生物有机肥和复合微生物肥中的有效活菌数含量要≥2000万/克。
在满足以上3个条件的情况下，用户可以根据所需要的功能选择含有特定功能菌种的微生物菌肥。
菌肥的质量要看其所含“有效活菌”的数量，活菌越多效果约好，特别说明要是活菌！ 除了适合的土壤温度和湿度外，土壤中的有机质含量和氮含量也会影响菌肥效果。重庆柑橘生物菌肥
“菌肥”的6个认知误区：
误区1：靠见效速度评价产品好坏，认为见效快的就是好菌剂或菌肥
肥料效果的发挥与微生物菌群繁殖速度、菌群数量关系紧密，菌群生长存在周期，这是与化学肥料和植物调节剂的比较大区别，也就出现了微生物肥料***性不如后两者的现象。
见效慢并不意味着品种是无效果的，能在较短时间内看到作物长势明显改善的品种未必是好品种，其中也不乏一些添加了植物调节剂的品种。
误区2：种类混乱，分不清使用的是菌剂还是菌肥
农用微生物菌剂是指目标微生物（有益菌）经过工业化生产扩繁后制成的活菌制剂；微生物菌肥包含复合微生物肥料和生物有机肥，分别指目的微生物经工业化生产增殖后与营养物质和主要动植物残体（如畜禽粪便、农作物秸秆等）为来源并经无害化处理的有机物料复合而成的活菌制品。
菌剂、菌肥比较大的区别在于产品中营养物质及有机物料的含量，使用中需结合实际需求选择对路产品。 便宜生物菌肥销售厂土壤中有足够的有机物或腐殖质时才能被微生物菌利用，进而使土壤微生物快速繁衍，***营养元素。
另外，相对于孢子来说，活菌的门槛是比较低的，它的生产工艺要求也没有那么高。因为孢子的休眠状态是在包装之前就发生了的，这一工艺在国内还存在着非常大的技术壁垒，目前并没有多少厂家能真正在包装之前使活菌进入休眠状态。
所以大部分生物菌的活菌在包装之前**多就是抽离水分的干燥处理而已，在包装过程中往往还有许多活菌处于活跃状态，它们在包装后的贮存期间必须进行自我休眠，但在这个过程中，活菌会死掉不少。这也是市面上活菌制剂的质量良莠不齐的主要原因之一。
而生物菌肥里的活菌往往在包装之后不能自动休眠，而始终处于活跃状态。一旦贮藏的时间过长，这些活菌基本上都死了，只剩下普通肥料的肥效。
综上所述，从官方发布的标准里，我们看到《农用微生物菌剂GB20287-2006》是没有有机质、氮磷钾的要求。但是菌含量、杂菌率等质量要求，是比执行《生物有机肥NY884-2012》类的要求高得多，如果是用普通生物有机肥料NY884-2012来冒充生物菌肥GB20287-2006标准，你可以举报它了。
如果你买的产品是“生物有机肥”，而执行“农用微生物菌剂”的国家标准，等于是该产品的技术参数提高了10倍；同时，它的原料必须经过高温灭菌才能保证杂菌率达标（一般的有机质中杂菌含量都超标）。这些都大幅度增加它的成本，好多厂家并没有按要求来做，所以提醒各位老乡，价格和价值往往是成正比的，千万不要贪小便宜，吃大亏，用生物菌肥的钱买了普通的生物有机肥料。 于各种常用化肥·有机肥配合使用，提高肥料的利用率，增产增收效果***。
生物肥对于果树主要有5大作用：
一、改变根量，由细菌产生的IAA、GA、CTK使植物次生根增殖，增加有效根量。
二、软化细胞壁，细菌产生的半聚糖醛酸转化酶（PATA）可软化根系细胞壁，从而促进营养吸收。
三、产生转铁产物，细菌产生的转铁产物可聚合或螯合土壤铁，使之成为对果树更有效的物质。
四、增加磷的有效性，细菌分泌出增加石灰性土壤中磷有效性的酸性物和螯合物。
五、阻止病害，细菌改变根际环境，从而***根系病原体的竞争力。 微生物与根系、根际土壤一起组成了农作物的‘肠胃’，很多有益微生物与根系形成互补共生关系。西安苹果生物菌肥
误区：靠见效速度评价产品好坏，认为见效快的就是好菌剂或菌肥。重庆柑橘生物菌肥
通过上表我们看到，有机物料腐熟剂同为执行《农用微生物菌剂GB20287-2006》的生物菌类产品，此类产品容易与农用微生物菌（肥）剂类产品混淆，注意要分清。此类产品的主要技术指标是：有效活菌数(cfu)含量为亿个/g或mL，粉剂和颗粒都要求≥0.5亿个/g，而液体要求≥1.0个/mL）；纤维素酶活（以农作物秸秆类为腐熟对象测定纤维素酶活），U/g（mL）≥30U，蛋白酶活（以畜禽粪便类为腐熟对象测定蛋白酶活），U/g（mL）≥15U。农用微生物菌剂和有机物料腐熟剂的保质期均为6个月（液体剂型的为≥3个月。重庆柑橘生物菌肥
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