用菌剂的过程中，并不单单使用菌剂，单独使用菌剂的话，效果会打折扣，需要为菌剂提供营养。
做的比较好的厂家在推广菌剂的时候，会跟腐殖酸或其他的有机肥配合使用，微生物赖以生存的主要还是碳和水，所以同一个产品还是在有机质含量高的地方效果好。
微生物肥料使用方式灵活多样。液体菌剂可以用来拌种、浸种、喷施、蘸根、灌根；固体菌剂可以用来拌种、蘸根、混播、混施，不同的使用方式对效果有一定的影响，应避免在土壤表层撒施、高温强光下喷雾，做底肥、沟施、穴施、灌根使用时采取局部用肥的方法会有利于肥效的发挥，与未腐熟的畜禽粪混合使用时，腐熟过程中的高温对菌剂活性和数量会产生影响，建议将畜禽粪腐熟后再混用。为更好的发挥微生物肥料效果，避免单一方式的使用，建议根据菌种的特性将以上方法组合使用。 土壤的组成是固相、液相、气相三类物质，主要包括矿物质、有机质、水分、空气和微生物。陕西高端微生物菌剂
微生物菌剂是指目标微生物（有效菌）经过工业化生产扩繁后，利用多孔的物质作为吸附剂（如草炭、蛭石），吸附菌体的发酵液加工制成的活菌制剂。这种菌剂用于拌种或蘸根，具有直接或间接改良土壤、恢复地力、预防土传病害、维持根际微生物区系平衡和降解0害物质等作用。
农用微生物菌剂恰当使用可以提高农产品产量、改善农产品品质、减少化肥用量、降低成本、改良土壤、保护生态环境。
按剂型可分为：液体、粉剂、颗粒型；
按内含的微生物种类或功能特性可分为：根瘤菌菌剂、固氮菌菌剂、解磷类微生物菌剂、硅酸盐微生物菌剂、光合细菌菌剂、有机物料腐熟剂、促生菌剂、菌根菌剂、生物修复菌剂等。
按照复合方式分为：微生物菌剂和复合微生物菌剂
农用微生物菌剂国家标准：（GB20287-2006）
复合菌剂：每一种有效菌的数量不得少于0.01亿/g（mL）；以单一的胶质芽胞杆菌制成的粉剂产品中有效活菌数不少于1.2亿/g。 四川茶叶微生物菌剂介绍土壤中施入微生物菌对于改良土壤、提升地力、改善土壤生态环境、提高农作物产量和品质具有极其重要的作用。
那么微生物菌剂是怎样做到促生新根、养根护根、防死苗烂根呢？
首先微生物菌剂促生根不同于其他肥料，微生物菌剂主要是通过施入土壤后开始繁殖分泌出来的分泌物作用于土壤中，间接作用于植物，从而促进生根的。
微生物菌剂中含有的大量活性有益菌，像枯草芽孢杆菌，在土壤中不断地生长发育繁殖，分泌大量的几丁质酶、生根素等物质作用于土壤中，间接作用于植物，同时还能够固氮解磷活钾，提高土壤中肥料的利用率，在做到爆发式生根的同时，还能进一步促进作物持续生根。
微生物菌是一种***菌种，其生存和繁殖必然需要充足的“食物”供应，而它的生长和繁殖是通过分解有机物质来完成的，所以我们可以把有机物质看作是微生物菌的“食物”，若有机质不足，微生物菌会因为“食物”不足而失去生存能力。在蔬菜栽培钟，有机质**主要的来源是有机肥，微生物菌剂与有机肥是一对好搭档。有机肥为蔬菜生长、土壤改良、微生物菌的存活提供大量的有机质和养分，这些养分在有益菌的分解下更利于蔬菜吸收，更利于缓解土壤疲劳，延长土壤使用寿命。因此，微生物菌剂与有机肥搭配施用，可将肥效达到1+1＞2的效果。有抑菌消菌的作用，就比如说我们都知道的哈茨木霉菌，它可以预防******害和细菌***害。
首先，微生物菌剂促生根的原理不同于生根剂生根粉促生根的原理。
生根剂生根粉促生根的原理：在作物生产应用中有吲哚乙酸、吲哚丁酸、萘乙酸，御根生，br生根剂，复硝酚钠等多个成分，是在植物体内维持植物的顶端优势，诱导同化产物向产品（果实）运输，促进植物生根等。
微生物菌剂促生根的原理：通过施入土壤后开始繁殖分泌出来的分泌物比如几丁质酶，生根素等物质改善土壤环境，间接作用于植物，并不是直接作用植物，基本适用于所有植物。 微生物在土壤中物质和能量的输入输出中扮演着非常重要的角色，是物质循环链上的重要环节。四川微生物菌剂制造商
有效菌可以分泌赤霉素、细胞分裂素、生长素等物质，可以刺激、调节、促进作物的生长发育，利于作物增产。陕西高端微生物菌剂
由于长期使用化学肥料，我国的土壤已经不再“健康”，土壤性状恶化、土地板结、土壤酸化、盐渍化、土壤微生物多样性被破坏等问题越来越突出，并直接导致了土壤贫瘠、地力衰竭等问题，影响了农业的可持续发展。在土壤生态如此恶劣的形势下，在改良土壤、提升地力、改善土壤生态环境、提高农作物产量和品质方面有着重要作用的微生物菌剂迎来发展机遇。
微生物菌剂正确定位属于特肥产品
农用微生物菌剂是指目标微生物（有效菌）经过工业化扩繁后加工制成的活菌制剂。它具有直接或间接改良土壤，恢复地力，维持根际微生物区系平衡，降解0、有害物质等作用，应用于农业生产，通过其中所含有的微生物的生命活力，增加根际养分的供应量或促进植物生长，改善农产品品质及农业生态环境。 陕西高端微生物菌剂
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