1、化肥中不含有机质、腐殖质，因此大量使用化肥，土壤由于有机质和腐殖质的缺乏，土壤团粒结构遭到破坏，造成土壤板结，农植物产量下降。
2、化肥利用率低，氮肥因为易挥发、流失，利用率只有30%-50%，磷肥的利用率才10%-25%，因为磷酸根化学活性活泼，施入土壤后大部分磷与土壤中的Zn2+、Mg2+、Ca2+、Fe3+、Al3+等阳离子结合形成难溶性磷肥。钾的利用率也只有50%左右。
3、化肥大量使用使蔬菜瓜果品质**下降。由于作物不仅*需要氮磷钾，同时还需要钙铁锌硒等许多微量元素，而化肥一般成分比较单一，所以长期使用化肥必然导致土壤中所含养分趋于单一，易使作物营养失调，从而导致作物内部转化合成受阻，必然导致作物品质下降，瓜不甜，菜不香。
4、危害人体健康。大量施用化肥，易使蔬菜中硝酸盐含量超标，而亚硝酸盐与胺类物质结合形成N-亚硝酸基化合物为强致*物质。
5、化肥的大量使用，还造成土壤的有益菌、蚯蚓的大量死亡。
6、化肥的长期低效施用，往往造成土壤中某些元素的过分积累和土壤理化性质的变化及环境的污染。
7、从中国大量使用化肥看，越使用化肥，地力就越下降，就越依赖化肥，由此形成恶性循环。 微生物肥料具有解磷、解钾、固氮的作用，促进土壤中微量元素的释放及螯合，可提高肥料利用率10％～30％。西安茶叶生物菌肥
果园多年不施有机肥和浅施无机肥，造成土壤板结，存氧量差，根系生长缓慢。土壤pH值发生变化。除草剂在土壤中的残留直接破坏了土壤的团粒结构使土壤中的微生物死亡。果园施用有机菌肥后，微生物被残留的除草剂等物质杀害，土壤中没有足够的微生物使菌肥发酵繁衍而形成有效的菌群，阻碍了肥效的发挥。多
果园要正确选择除草剂，既要能除草，又在土壤中残留时间短，对土壤中微生物和土壤团粒结构没有太大的破坏。重视有机肥的施用，改良土壤得3～5年。
四川生物菌肥电话在土壤状况比较正常的情况下，一般以亩（667平方米）施用生物菌肥80公斤左右为宜。
来自河北省保定市满城区段旺村的葡萄果农李占国，前些年，因为果园偏盐碱。
种植七八年的“巨峰”葡萄出现黄叶现象，而且越来越严重，他于是加量施肥，结果黄叶越来越多，产量还降了，后来技术人员判断说是化肥使用过多，伤根严重。
于是改用菌肥进行调理，半年后，叶片宽大浓绿有光泽、厚实，比之前有很大改观。秋季收获时，葡萄上色好，均匀，糖度达19.3Brix%，甚是喜人！甘肃省平凉市静宁县威戎镇新胜村的果农王宏斌的果树树龄已12年，之前树势较弱，果子整体偏小，产量不高，连续使用菌肥后，树势增强，果个变大，亩产接近5000斤，成了名副其实的高产园。去年在其它果园果价1.5元左右的情况下，他的苹果以2.7元/斤的高价被果商收购。
适量施用
土壤中施入较多的菌肥，虽然不会出现烧根烧苗现象，但也并不是施得越多就越好。盲目大量施用生物菌肥，虽然不会向化学肥料那样造成蔬菜烧根死苗，只是蔬菜植株体内盐类积累增加，有害消费者的圣体健康，恶化土壤质地，但**起码增加了肥料投入成本（因为生物菌肥价格较高），降低蔬菜的栽培效益。因此，应根据不同作物的需要和土壤养分状况，科学地确定生物菌肥施肥量，才能达到增产增收的目的。
在土壤状况比较正常的情况下，一般以亩（667平方米）施用生物菌肥80公斤左右为宜。如果土壤盐渍化程度较高，可适当增加生物菌肥的施用量。一般根据土壤的盐渍化程度高低，每亩（667平方米）可适当增施10～20公斤为宜。 微生物肥料中有益微生物能产生糖类物质，与植物粘液、矿物胚体和有机胶体结合在一起。
“菌肥”的6个认知误区：
误区1：靠见效速度评价产品好坏，认为见效快的就是好菌剂或菌肥
肥料效果的发挥与微生物菌群繁殖速度、菌群数量关系紧密，菌群生长存在周期，这是与化学肥料和植物调节剂的比较大区别，也就出现了微生物肥料***性不如后两者的现象。
见效慢并不意味着品种是无效果的，能在较短时间内看到作物长势明显改善的品种未必是好品种，其中也不乏一些添加了植物调节剂的品种。
误区2：种类混乱，分不清使用的是菌剂还是菌肥
农用微生物菌剂是指目标微生物（有益菌）经过工业化生产扩繁后制成的活菌制剂；微生物菌肥包含复合微生物肥料和生物有机肥，分别指目的微生物经工业化生产增殖后与营养物质和主要动植物残体（如畜禽粪便、农作物秸秆等）为来源并经无害化处理的有机物料复合而成的活菌制品。
菌剂、菌肥比较大的区别在于产品中营养物质及有机物料的含量，使用中需结合实际需求选择对路产品。 当前肥料品类繁多，从各种化肥、复合肥到各种有机肥、生物菌肥、多肽酶肥、有机无机肥等，五花八门。西安茶叶生物菌肥
微生物在其繁殖和代谢过程中，可以降解土壤中残留的化肥、有机农药、重金属和其他污染物等。西安茶叶生物菌肥
使用生物菌肥，一是能多施尽量多施，二是要连年施用。
近几年来，生物菌肥的推广力度不断加大，在果园秋季施肥环节中，农资经销商推荐的生物菌肥加大化肥的的配方建议，也越来越得到了大家的认可。生物菌肥的主要成分是有机肥加有益菌。
这两者对改良土壤、提高树体“体质”的作用，是大化肥所不能替代的。土壤改良了，树体“体质”提高了，根腐病、黄叶病、流胶病、小叶病等长期难以**的“慢性”病害就能够得到缓解。
但是，要达到缓解“慢性”病的效果，是需要相当长时间的，不可能很快见效。曾有一位农民，果园根腐病严重，在**建议下开始使用生物菌肥。 西安茶叶生物菌肥
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