1、微生物在土壤中物质、能量的输入输出中扮演着非常重要的角色，能够活化土壤有机与无机养分，分解有机物，释放养分，增加养分的有效性；
2、微生物通过代谢过程中氧气和二氧化碳的交换以及分泌的有机酸等酸性物质，促进土壤中微量元素的释放及螯合，有效打破土壤板结，促进团粒结构的形成，并能改善土壤的通气状况，促进有机质、腐殖酸和腐殖质的生成；
3、微生物在其繁殖和代谢过程中，可以降解土壤中残留的化肥、有机农药、重金属和其他污染物等，降低土壤污染的程度。
而微生物菌剂隶属于生物肥料这个大类，对土壤各种问题的解决具有奇效。微生物菌剂的使用**减少了化肥的用量及减少污染，而且通过微生物之间或与植物之间的互相作用，植物的抗病与抗逆能力**增强，这对于提高农作物品质及产量有着重要意义。 微生物肥料包含微生物接种剂（农用微生物菌剂）、复合微生物肥料、生物有机肥。四川香蕉微生物菌剂
我国微生物肥料是从豆科植物上应用根瘤菌接种剂开始的，起初只有大豆和花生根瘤菌剂。50年代，从原苏联引进自生固氮菌、磷细菌和硅酸盐细菌剂，称为细菌肥料；60年代又推广使用放线菌制成的“5406”抗生菌肥料和固氮蓝绿藻肥；70-80年代中期，又开始研究VA菌根，以改善植物磷素营养条件和提高水分利用率；80年代中期至90年代，农业生产中又相继应用联合固氮菌和生物钾肥作为拌种剂。这3次的发展都不稳定，其主要原因是产品质量无保证、无标准，行业无监管，以致每次发展的时间都不长。桂林多功能微生物菌剂阶格分解、释放多种中微量元素，可以使作物更好的吸收，提高作物体内蛋白质、氨基酸、糖分等含量。
行业混乱，缺乏规范和标准
我国微生物菌剂（菌肥）存在的问题主要为以下几点：行业小散乱，缺规范；科研天很高，脚微软；产品品种多，不成片；宣传高大全，净优点；代理利不小，上量难；农民不会用，怕受骗。同时，菌剂增长困难问题表现主要有：1.***，代替所有肥被神化；2.流于形式，零售800元，被俗化；3.叫好不叫座，农民接受困难，被虚化；4.即将被植物生长刺***取代的说法，被衰化。总的来说，微生物菌剂的问题是行业过于混乱，缺乏规范的标准和市场环境。
张永军是安徽的葡萄种植户，面积有300亩，去年开始使用微生物菌剂，主要针对改良土壤、改善葡萄品质，据张师傅介绍，微生物菌剂产品的确解决了很多的土壤问题，用完长势要好很多，根系发达，叶片厚，主要是葡萄品质好，口感好，糖度能达到20-22。
当问到，为什么张师傅要使用微生物菌剂时，他表示自己也听**老师介绍过，园子里大量元素都不缺，缺少的是微生物、有机质类的。葡萄园存在重茬，需要抗重茬。他就开始使用微生物菌剂，使用后的主要印象就是微生物菌剂对根系影响比较大。 健康的土壤中包括45%左右的矿物质、25%左右的空气、25%左右的水、5%左右的有机质和1%左右的微生物。
张永军是安徽的葡萄种植户，面积有300亩，去年开始使用微生物菌剂，主要针对改良土壤、改善葡萄品质，据张师傅介绍，微生物菌剂产品的确解决了很多的土壤问题，用完长势要好很多，根系发达，叶片厚，主要是葡萄品质好，口感好，糖度能达到20-22。张师傅的葡萄园采用滴灌水肥一体化，微生物菌剂产品配合着含腐殖酸的水溶肥使用，一亩地每次用5公斤，在葡萄生长期用3——4次，用过之后，葡萄土壤明显疏松，不板结，葡萄很少裂果，口感好，价位就高。张师傅的园子一部分是采摘，一部分收购，收购价要比其他的高出5毛左右。葡萄园是4年的园龄，用了底肥和冲施两种，底肥直接做为基肥代替了农家肥像鸡粪类的，人工费就比鸡粪贵，而且鸡粪用火碱消毒，使用后还可能烧根，配合着微生物菌剂使用，不仅能解决问题还能减少人工费用的开支。工业化、现代化的发展进程中，经济快速发展，引起了一系列的环境问题。桂林多功能微生物菌剂阶格
有效菌可以分解土壤中的有机质，并且生成腐殖酸可与土壤中的氮形成腐殖酸铵，减少氮肥流失。四川香蕉微生物菌剂
正如国家苹果工程技术研究中心杨杰教授所说：“作物长不好的原因是作物的根不好，作物的根不好是因为土不好，土不好是因为土壤里缺乏大量的有益微生物菌，所以解决当前土壤生态质量和作物产量的当务之急是在土壤中使用质量微生物菌剂。”
要使土壤恢复健康，应先知道土壤健康的标准是什么？
土壤的组成是固相、液相、气相三类物质，主要包括矿物质、有机质、水分、空气和微生物。
土壤中这三类物质互相联系、互相制约，是具有一定结构的有机整体。
因此，土壤健康的标准也由这三类物质进行界定：健康的土壤中包括45%左右的矿物质、25%左右的空气、25%左右的水、5%左右的有机质和1%左右的微生物。
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