菌肥中的菌赖以生存的条件是有机质。而80%以上的果园都在施用无机化肥，土壤板结透气性差，使得一些厌气菌大量繁殖，如镰刀菌、齐整小核菌等，菌种的繁殖跟扩散需要有机质跟湿度合理搭配。
更严重的是有机肥极度缺乏破坏了土壤的团粒结构，降低了土壤的保肥保水能力。果农施商品有机菌肥一般每亩都在40公斤左右，有机质很快被分解利用，有机肥中的菌种失去赖以生存的条件不能繁衍生存，大部分死亡。这就是果农在施用商品有机菌肥中发现的地厚施有机菌肥有作用而地薄无作用的道理。
强降雨也会让菌肥效果降低。大多数微生物菌肥中的菌都是有氧细菌，需要有氧呼吸。桂林猕猴桃生物菌肥
在国家颁布的微生物肥料执行标准中，都允许生产颗粒性微生物肥料。
《生物有机肥》执行标准中规定：粉剂产品应松散、无恶臭味；颗粒产品应无明显机械杂质、大小均匀、无***味。
《复合微生物肥料》执行标准中规定：产品按剂型分为液体、粉剂、颗粒型。粉剂产品应松散；颗粒产品应无明显机械杂质、大小均匀、具有吸水性；
《农用微生物菌剂》执行标准中规定：产品按剂型可分为液体、粉剂、颗粒型。由以上国家规定来看，说粉剂微生物肥料是真，颗粒微生物肥料是假，纯属子虚乌有。 贵州苹果生物菌肥阶格生物菌适合与有机质共同使用，但是与氮磷钾等复合肥料共用，能杀死部分微生物菌，降低肥效。
微生物菌肥的神奇效果引起了各个层面的高度关注。目前，微生物肥料的应用范围基本涵盖了粮食、蔬菜、果树、中草药、***等各种类型的作物。
农业部全国农技中心技术促进处处长马常宝2016年在《中国微生物肥料产业发展状況》报告中指出，目前中国微生物肥料应用主要集中在三大区域：
一是南方水稻种植区域，2013年应用面积达到4700万亩，用量超过10万吨。
二是大中城市周边区域，该区域多为蔬菜、水果等经济价值较高的种植区域，应用微生物肥料可提高农产品品质，减少土传病害的发生，增加农产品的经济价值。
三是珠三角、长三角的污染耕地区域，正在探索应用微生物肥料***重金属、降低农药用量，保护生态环境的技术方法和措施。
我们在使用这类生物菌之前，必须要先将其放在水分充足的环境中静置30~60分钟。不管是喷施用的还是土埋用的，使用之前都必须经过这样的处理。
其次，***后的孢子，其寿命只有一个月左右的时间。有果农说，它不是可以繁殖的吗？非也，只有未经过改良的活菌才能繁殖，而经过改造的孢子是不具备这个功能的，哪怕是孵化之后的孢子也没有。也就是说，我们用这种生物菌的时候，本来有多少孢子，用到田里时**多也就只有这么多活菌，往后活菌只会越来越少，不会增多。
那么包装袋上显示的是“XX亿活菌”字样的生物菌呢？毋庸置疑，它是完全具备增殖能力的。这么说来，岂不是我们把这类生物菌施下去以后，它就可以持续繁殖下去发挥作用了？小心别被厂家的宣传蒙骗了！活菌具有增殖能力不假，但他们没有告诉你的是，它还会退化。
其实一般的生物菌持效期都是在90天左右。因为驯化后的活菌**多只能保持2~3代的现有性状繁殖，3代以后就会出现退化。那个时候，它也就不再具备厂家宣传上所说的功效了。 一般的生物菌持效期都是在90天左右。因为驯化后的活菌**多只能保持2~3代的现有性状繁殖，然后出现退化。
施用有机菌肥的关键要不断培养土壤中的微生物。土壤中有足够的有机物或腐殖质时才能被微生物菌利用，进而使土壤微生物快速繁衍，***营养元素。
实行果园生草制。草长到15厘米不到20厘米时割刈，一年反复进行覆盖地面，两年全园普翻一次以利提高果园腐殖质的含量。
施发酵好的牛、猪、羊、兔等家畜禽粪。为有机菌肥中菌种的发酵繁殖提供充足的基质。为果树在生长中提供中、微量元素，减少小叶、黄叶等生理病害的发生。
微生物菌在土壤中作用主要是产生各种酶，分解各种养分，产生各种酸和二氧化碳，给作物提供更多养分。而微生物菌要成活和繁殖，土壤中要有足够的有机质才行。 微生物肥料具有解磷、解钾、固氮的作用，促进土壤中微量元素的释放及螯合，可提高肥料利用率10％～30％。贵州生物菌肥零售价格
我们常说，没有有机质，就没有肥沃的土壤。有机质对农作物是极其重要的，是农作物的重要营养来源。桂林猕猴桃生物菌肥
生物菌肥主要作用：
1、提高土壤肥力：有些菌剂可以增加土壤中氮磷钾营养元素的含量；还可以提高一些土壤酶类活性，有利于土壤中养分的转化方便植物的吸收利用。
2、促进难溶的矿质营养释放：生物菌肥使土壤酶活性提高，使不溶性土壤养分溶解利于植物吸收。同时，还分泌一些有机酸性物质，能分解有机质，产生的糖有利于固氮细菌的生长。
3、帮助农作物吸收养分：如根瘤菌可刺激豆科植物的根部形成根瘤，使土壤中的氮转化为作物能吸收的氮肥。
4、增强植物抗病(虫)能力：生物菌肥中的微生物在土壤中能分泌***、杀虫剂及植物生长***。***及杀虫剂能杀灭植物病害及害虫的虫卵，植物生长***促进叶绿素含量升高，提高植物光合作用的能力。
5、增强植物的抗逆能力：有些生物菌肥施用后，在土壤中大量生长繁殖，聚集在作物根部形成优势菌群，在其自身生长过程的同时，改善周围的环境，提高植物体的抗逆性。
6、提高作物品质：菌群中的侧孢芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、凝结芽孢杆菌等可降低植物体内硝酸盐含量20%以上，能降低重金属含量，可使果实中Vc含量提高30%以上，可溶性糖提高2~4度。
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