施用时要均匀施于垄沟内，然后起垄；如不施用有机肥，以1千克生物肥拌30-50千克稍湿润的细土，均匀施于垄沟内，然后即起垄覆土，注意与化肥隔开使用。在水田或旱田也可以均匀撒施于地表，然后立即耙入土中，不能长时间暴露在阳光下暴晒。3、口肥：在施用有机肥或化肥做基肥的基础上，用生物菌肥做种肥，或掩播作物做种肥使用，刨掩后将拌有细土的生物菌肥施于掩中，再点种。4、拌种：先将种子表面用水或用豆浆、红糖水喷湿润，然后将种子放入菌肥中搅拌，使种子表面均匀沾满菌肥后，在阴凉通风处稍阴干即可播种。拌种后不要放置在阳光下暴晒，也不要放置时间过长。菌剂、菌肥比较大的区别在于产品中营养物质及有机物料的含量，使用中需结合实际需求选择对路产品。广东湿地生物菌肥价格实惠
5.微生物肥料不论是做基肥，还是追肥，都不能暴露在土壤表面。由于阳光照射，使微生物的活性下降。6.注意生产日期，放置时间过长的微生物肥料中的微生物的活性下降。7.冬春季保护地中的地温低，低温微生物的生长繁殖变慢、活性下降。应提高地温，用秸秆覆盖，有利于提高地温，增强微生物活性的作用。微生物菌肥有明显减少蔬菜体内硝酸盐，亚硝酸盐和重金属含量，提高化肥利用率以及培肥土壤等作用，我们应做好微生物菌肥的合理化施用。中国台湾常规生物菌肥制造商生物菌肥以粉末或液体形式提供，易于施用于不同作物和土壤类型，操作简便，适用性较广。
根际环境保护屏障：菌群中的地衣芽孢杆菌等有益微生物施入土壤后，迅速繁殖成为优势菌群，控制根际营养和资源，使重茬、根腐、立枯、流胶、灰霉等病原菌丧失生存空间和条件。使植物根系细胞的细胞壁增厚，纤维化、木质化，并生成角质双硅层，形成阻止病原菌侵袭的坚固屏障。增强抗逆性：菌肥中的微生物在植物根部大量生长、繁殖，从而形成优势菌群，优势菌群形成局部优势，这样就能***和减少病原菌的入侵和繁殖机会，起到了减轻作物病害的功效。菌群中的地衣芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、侧孢芽孢杆菌等有益微生物可增强土壤缓冲能力，保水保湿，增强作物抗旱、抗寒、抗涝能力；同时侧孢芽孢杆菌还可强化叶片保护膜，抵抗病原菌侵染，抗病，抗虫。能松土保肥、改善环境：丰富的有机质还可以改良土壤物理性状，改善土壤团粒结构，从而使土壤疏松，减少土壤板结，有利于保水、保肥、通气和促进根系发育，为农作物提供适合的微生态生长环境。有益菌刺激有机质释放营养：菌群中的巨大芽孢杆菌、胶冻样芽孢杆菌等有益微生物在代谢过程中产生大量的植物内源酶，可明显提高作物对氮、磷、钾等营养元素的吸收率。大量的有机质通过有益微生物活动后，可不断释放出植物生长所需的营养元素。
种类混乱，分不清使用的是菌剂还是菌肥农用微生物菌剂是指目标微生物（有益菌）经过工业化生产扩繁后制成的活菌制剂；微生物菌肥包含复合微生物肥料和生物有机肥，分别指目的微生物经工业化生产增殖后与营养物质和主要动植物残体（如畜禽粪便、农作物秸秆等）为来源并经无害化处理的有机物料复合而成的活菌制品。菌剂、菌肥比较大的区别在于产品中营养物质及有机物料的含量，使用中需结合实际需求选择对路产品。避免光照直射。光照直射的情况下，一些菌都会杀死。除了适合的土壤温度和湿度外，土壤中的有机质含量和氮含量也会影响菌肥效果。
生物菌肥具有以下特点：有机性：生物菌肥主要由有机物质组成，不含化学合成的化肥成分，对土壤和环境无污染。菌种丰富：生物菌肥中含有多种有益微生物菌种，能够促进土壤中的生物活性，改善土壤结构。营养：生物菌肥中的微生物菌种能够分解有机物质，释放出植物所需的养分，提供多方面的营养供给。促进植物生长：生物菌肥中的微生物菌种能够与植物根系形成共生关系，促进植物的生长和发育。提高作物抗病能力：生物菌肥中的微生物菌种提高作物的抗病能力。增加土壤肥力：生物菌肥中的微生物菌种能够分解有机物质，增加土壤的有机质含量，提高土壤肥力。分解土壤中有机质，可减少氮素的流失，解钾溶磷提高肥料利用率，降低生产投入，减少资源浪费。中国台湾常规生物菌肥制造商
《农用微生物菌剂GB 20287-2006》是没有有机质、氮磷钾的要求。但是菌含量、杂菌率等质量要求。广东湿地生物菌肥价格实惠
认为一种产品中菌的种类越多、菌种数量越大越好复合菌剂的使用效果会受到不同菌种生长习性的影响，盲目的复合，极易造成菌种间的拮抗，影响效果发挥。产品使用后起作用的只有活菌，因此菌衡量的标准为“有效活菌数（CFU）”，有效活菌数量越大效果越好。此外，菌的纯度也至关重要，当产品中霉菌杂菌数及杂菌率超标时也会影响应用。市场上少数不合格产品中含有致病菌，不仅修复不了土壤，还会导致病害发生。不能与农药混用。化肥农药大面积混在一起的时候很可能会把菌杀死，施了生物菌肥以后，接着倒上杀菌药，广东湿地生物菌肥价格实惠
